Στον επόμενο αιώνα, ένα αναδιαμορφούμενο σκάφος (σκεφτείτε το "Transformer" με πιλότο) που ονομάζεται Macross μεταφέρει πενήντα χιλιάδες πρόσφυγες στα αμπάρια του καθώς επιστρέφει στη Γη καταδιωκόμενο από γιγάντιους ανθρωποειδείς πολεμιστές. Ένας νεαρός πιλότος του στρατού ονόματι Hikaru σώζει το είδωλό του, την όμορφη τραγουδίστρια Lynn Minmay, από τους γίγαντες καθώς αυτοί διαρρηγνύουν το κύτος του σκάφους κατά τη διάρκεια μιας συναυλίας -κατά την οποία οι γίγαντες σοκάρονται βλέποντας γυναίκες σε ένα αντρικό σκάφος- και παγιδεύονται για μέρες σε ένα πρυμναίο αμπάρι του σκάφους.