Ο Lincoln Six Echo ( Ewan McGregor ) νομίζει πως είναι ένας από τους τελευταίους επιζώντες στην γη μετά από μια οικολογική καταστροφή. Οι επιζώντες αυτοί διατηρούνται σε παιδική διανοητική κατάσταση στο επιστημονικό κέντρο που διαμένουν και που τους απαγορεύεται να εγκαταλείψουν. Καλή του φίλη είναι και η Jordan Two Delta (Scarlett Johansson) η οποία κάποια στιγμή κερδίζει το εισιτήριο για «Tο Nησί», το μοναδικό μέρος που δεν έχει επηρεαστεί από την οικολογική καταστροφή. Η αλήθεια όμως είναι πολύ διαφορετική: Ολοι οι κάτοικοι του κέντρου είναι κλώνοι ανθρώπων έτοιμοι να πεθάνουν μόλις τα όργανά τους χρειαστούν και η Jordan με τον Lincoln που μαθαίνει το τρομερό μυστικό πρέπει πλέον να τρέξουν για την ζωή τους.